Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Fam20bQ8VCS3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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