Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Ercc8Q8CFD5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ercc8Q8CFD5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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