Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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