Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf428Q8C1M2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms