Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms