Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrtm1Q8BXQ3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms