Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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