Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Kdm4aQ8BW72 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Kdm4aQ8BW72 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Kdm4aQ8BW72 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Kdm4aQ8BW72 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kdm4aQ8BW72 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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