Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Pggt1bQ8BUY9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Pggt1bQ8BUY9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Pggt1bQ8BUY9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Pggt1bQ8BUY9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Pggt1bQ8BUY9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Pggt1bQ8BUY9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Pggt1bQ8BUY9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Pggt1bQ8BUY9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Pggt1bQ8BUY9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Pggt1bQ8BUY9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Pggt1bQ8BUY9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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