Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp43Q8BUM9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms