Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ubash3bQ8BGG7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ubash3bQ8BGG7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ubash3bQ8BGG7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ubash3bQ8BGG7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ubash3bQ8BGG7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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