Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8BGC1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms