Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3cQ80U95 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3cQ80U95 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms