Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NischQ80TM9 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms