Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms