Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms