Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Topbp1Q6ZQF0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms