Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trak1Q6PD31 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms