Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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