Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Krt40Q6IFX3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Krt40Q6IFX3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Krt40Q6IFX3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Krt40Q6IFX3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt40Q6IFX3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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