Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pram1Q6BCL1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms