Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms