Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a5Q63ZW6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms