Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Foxd1Q61345 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Foxd1Q61345 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Foxd1Q61345 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Foxd1Q61345 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Foxd1Q61345 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Foxd1Q61345 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms