Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc1Q61191 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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