Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Cln3Q61124 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Cln3Q61124 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cln3Q61124 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cln3Q61124 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms