Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms