Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms