Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf215Q5SPX3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf215Q5SPX3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf215Q5SPX3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf215Q5SPX3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf215Q5SPX3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf215Q5SPX3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf215Q5SPX3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf215Q5SPX3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf215Q5SPX3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf215Q5SPX3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rnf215Q5SPX3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf215Q5SPX3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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