Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rtl5Q5DTT4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rtl5Q5DTT4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rtl5Q5DTT4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rtl5Q5DTT4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Rtl5Q5DTT4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Rtl5Q5DTT4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Rtl5Q5DTT4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Rtl5Q5DTT4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Rtl5Q5DTT4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Rtl5Q5DTT4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Rtl5Q5DTT4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Rtl5Q5DTT4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl5Q5DTT4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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