Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Syne3Q4FZC9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Syne3Q4FZC9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Syne3Q4FZC9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Syne3Q4FZC9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syne3Q4FZC9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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