Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shank3Q4ACU6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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