Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd5Q3V1H9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms