Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrc43Q3V0L5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrc43Q3V0L5 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrc43Q3V0L5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrc43Q3V0L5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lrrc43Q3V0L5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lrrc43Q3V0L5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lrrc43Q3V0L5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lrrc43Q3V0L5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lrrc43Q3V0L5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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