Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm28047Q3US59 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Gm28047Q3US59 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28047Q3US59 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28047Q3US59 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28047Q3US59 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28047Q3US59 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28047Q3US59 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28047Q3US59 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28047Q3US59 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28047Q3US59 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28047Q3US59 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Gm28047Q3US59 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28047Q3US59 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28047Q3US59 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm28047Q3US59 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms