Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp19Q3UJD6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms