Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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