Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms