Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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