Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms