Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms