Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms