Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms