Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf541Q0GGX2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms