Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms