Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
F13bQ07968 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms