Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Cntn3Q07409 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Cntn3Q07409 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Cntn3Q07409 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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