Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aplp2Q06335 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms