Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms