Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms